Когда таинственная группа Синоби совершает неожиданное нападение на Коноху, деревню оставляют в руинах. Только тогда становится ясно, что очередная мировая война шиноби может стать реальностью. Между тем, Сасуке, который покинул Коноху, чтобы отомстить за свой клан, убив своего брата Итачи, появляется второй раз перед своими друзьями.